Pares de ADN (adenina-timina, guanina-citosina)[cerrado]

En Principles of Nucleic Acid Structure , W. Saenger sostiene que las bases con enlaces de hidrógeno contienen al menos dos enlaces de hidrógeno (formando un motivo «cíclico»). A menudo hay una forma tautomérica posible que también crea dos enlaces de hidrógeno, con dos enlaces covalentes que se convierten en enlaces de hidrógeno, dos enlaces de hidrógeno que se convierten en enlaces covalentes y dobles enlaces que se mueven de manera que cada átomo siempre tiene un octeto. En el primer ejemplo de OPs (par A: T), por ejemplo, la cetona se convertiría en un enol y la protonación de los grupos amino e imino cambiaría.

Saenger continúa diciendo que son posibles 28 pares.

Se observan muchos de ellos (los marcados son tan comunes que se les ha dado nombre), en las estructuras del ADN, del ARN y en las estructuras cristalinas de los dinucleótidos.

Me preguntaba por qué la adenina se empareja con la timina y la citosina con la guanina.

Se emparejan porque crean fuertes enlaces de hidrógeno con una geometría de pares de bases que permite el apilamiento de bases y es compatible con el emparejamiento de bases de otros nucleótidos en una cadena de ADN. Como la discusión anterior muestra, muchos otros pares de bases son teóricamente posibles, y algunos de ellos se observan realmente en la naturaleza.

La timina tiene la menor acidez y la adenina tiene la mayor acidez. Así que tiene sentido que el enlace intermolecular sea fuerte.

No estoy seguro de la premisa, y la conclusión es incorrecta, porque también se forman otros pares de bases. Mientras un grupo tenga el estado de protonación correcto, el pKa no determina directamente la fuerza del enlace de hidrógeno.

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