Pares de ADN (adenina-timina, guanina-citosina)[closed]

In Principles of Nucleic Acid Structure , W. Saenger argumenta que as bases ligadas ao hidrogénio contêm pelo menos duas ligações de hidrogénio (formando um motivo “cíclico”). Muitas vezes existe uma possível forma tautomérica que também cria duas ligações de hidrogénio, com duas ligações covalentes transformando-se em ligações de hidrogénio, duas ligações de hidrogénio transformando-se em ligações covalentes, e ligações duplas movendo-se de modo a que cada átomo tenha sempre um octeto. No primeiro exemplo de OPs (A: Par T), por exemplo, a cetona transformar-se-ia num enol e a protonação dos grupos de amino e imino mudaria.

Saenger prossegue dizendo que são possíveis 28 pares.

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Muitos destes são observados (os marcados são tão comuns que lhes foram dados nomes), nas estruturas de ADN, RNA e nas estruturas cristalinas dos dinucleótidos.

Interrogava-me porquê pares de adenina com pares de timina e citosina com guanina.

Classificam porque criam fortes ligações de hidrogénio com uma geometria de par de bases que permite o empilhamento de bases e é compatível com o emparelhamento de bases de outros nucleótidos num fio de ADN. Como a discussão acima mostra, muitos outros pares de bases são teoricamente possíveis, e alguns deles são realmente observados na natureza.

Thymine tem a menor acidez e adenine tem a maior acidez. Portanto, faz sentido que a ligação intermolecular seja forte.

Não tenho a certeza sobre a premissa, e a conclusão é incorrecta, porque outros pares de bases também são formados. Enquanto um grupo tiver o estado correcto de protonação, o pKa não determina directamente a força da ligação de hidrogénio.

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